3月18日，广东省人民政府网站发出公告：广东省人民政府关于虎门二桥车辆通行费收费标准有关问题的批复。批复表示，同意虎门二桥交工验收通车和收费站收费设施经验收符合省联网收费技术要求后开始收费，收费车型按国家统一标准进行分类，1至5类车的收费系数分别为1、1.5、2、3、3.5，客车实行按次计费，东涌互通立交至海鸥岛互通立交段收费标准为18元/标准车次，海鸥岛互通立交至沙田互通立交段收费标准为24元/标准车次；货车实行完全计重收费，东涌互通立交至海鸥岛互通立交段基本费率为0.54元/吨公里，海鸥岛互通立交至沙田互通立交段基本费率为0.77元/吨公里。
经计算，标准车次走完虎门二桥全程需缴费42元。就普通家用小轿车来说，通行虎门大桥单程40元，虎门大桥一共4.6公里，平均近9元/公里；通行虎门二桥单程是42元，通行总价比虎门大桥贵2元，不过虎门二桥大桥主线全长12.9公里，平均算下来约3.3元/公里，每公里单价比虎门大桥更便宜。
虎门二桥是《粤港澳大湾区发展规划纲要》公布后首个即将投用的“超级工程”，将在清明节前通车。建成通车后，从广州到东莞的路程可缩短10公里，车程比现在缩短约半小时。
